Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP13A2Q9NQ11 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms