Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1DQ9H5J8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms