Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLSTN2Q9H4D0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLSTN2Q9H4D0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms