Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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FOXQ1Q9C009 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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