Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM208Q9BTX3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM208Q9BTX3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms