Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOL4Q9BPW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms