Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms