Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms