Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms