Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms