Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms