Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms