Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL34Q8N239 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms