Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms