Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms