Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms