Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms