Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms