Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRAD1Q5T700 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms