Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTXN3Q4LDR2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms