Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRFIP1Q32MZ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRFIP1Q32MZ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms