Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIP4Q15650 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIP4Q15650 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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