Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF235Q14590 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms