Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3AQ14563 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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