Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA7Q13683 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA7Q13683 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA7Q13683 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms