Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRQ13535 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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