Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRSQ13332 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRSQ13332 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRSQ13332 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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