Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLN3Q13286 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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