Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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