Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms