Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAD51Q06609 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms