Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN11Q06124 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms