Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPEQ02224 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms