Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3AP98173 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FAM3AP98173 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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FAM3AP98173 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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