Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB1P82279 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRB1P82279 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRB1P82279 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRB1P82279 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRB1P82279 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB1P82279 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB1P82279 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB1P82279 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms