Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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