Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FNTBP49356 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FNTBP49356 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FNTBP49356 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FNTBP49356 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FNTBP49356 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FNTBP49356 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms