Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB2P35606 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB2P35606 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB2P35606 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms