Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC4P35249 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC4P35249 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC4P35249 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC4P35249 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC4P35249 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms