Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPREP23469 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPREP23469 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPREP23469 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPREP23469 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPREP23469 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPREP23469 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms