Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNB1P20700 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms