Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRHP20396 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRHP20396 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRHP20396 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRHP20396 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TRHP20396 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRHP20396 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRHP20396 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms