Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms