Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms