Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB1P08034 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB1P08034 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB1P08034 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB1P08034 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms