Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPLO60437 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPLO60437 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPLO60437 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PPLO60437 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPLO60437 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPLO60437 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPLO60437 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPLO60437 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPLO60437 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPLO60437 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms