Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN3BO60391 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms