Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIAH2O43255 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIAH2O43255 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms