Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRTO14522 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
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