Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHL1O00533 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHL1O00533 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHL1O00533 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms